mirror of https://github.com/Chizi123/.emacs.d.git

Chizi123
2018-11-21 e75a20334813452c6912c090d70a0de2c805f94d
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
;;; org-bibtex.el --- Org links to BibTeX entries    -*- lexical-binding: t; -*-
;;
;; Copyright (C) 2007-2018 Free Software Foundation, Inc.
;;
;; Authors: Bastien Guerry <bzg@gnu.org>
;;       Carsten Dominik <carsten dot dominik at gmail dot com>
;;       Eric Schulte <schulte dot eric at gmail dot com>
;; Keywords: org, wp, capture
;;
;; This file is part of GNU Emacs.
;;
;; GNU Emacs is free software: you can redistribute it and/or modify
;; it under the terms of the GNU General Public License as published by
;; the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
;; (at your option) any later version.
 
;; GNU Emacs is distributed in the hope that it will be useful,
;; but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
;; MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
;; GNU General Public License for more details.
 
;; You should have received a copy of the GNU General Public License
;; along with GNU Emacs.  If not, see <https://www.gnu.org/licenses/>.
;;
;;; Commentary:
;;
;; This file implements links to database entries in BibTeX files.
;; Instead of defining a special link prefix, it uses the normal file
;; links combined with a custom search mechanism to find entries
;; by reference key.  And it constructs a nice description tag for
;; the link that contains the author name, the year and a short title.
;;
;; It also stores detailed information about the entry so that
;; capture templates can access and enter this information easily.
;;
;; The available properties for each entry are listed here:
;;
;; :author        :publisher      :volume      :pages
;; :editor        :url            :number      :journal
;; :title         :year           :series      :address
;; :booktitle     :month          :annote      :abstract
;; :key           :btype
;;
;; Here is an example of a capture template that use some of this
;; information (:author :year :title :journal :pages):
;;
;; (setq org-capture-templates
;;   '((?b "* READ %?\n\n%a\n\n%:author (%:year): %:title\n   \
;;          In %:journal, %:pages.")))
;;
;; Let's say you want to capture this BibTeX entry:
;;
;; @Article{dolev83,
;;   author =      {Danny Dolev and Andrew C. Yao},
;;   title =      {On the security of public-key protocols},
;;   journal =      {IEEE Transaction on Information Theory},
;;   year =      1983,
;;   volume =     2,
;;   number =     29,
;;   pages =     {198--208},
;;   month =     {Mars}
;; }
;;
;; M-x `org-capture' on this entry will produce this buffer:
;;
;; =====================================================================
;; * READ <== [point here]
;;
;; [[file:file.bib::dolev83][Dolev & Yao 1983: security of public key protocols]]
;;
;; Danny Dolev and Andrew C. Yao (1983): On the security of public-key protocols
;; In IEEE Transaction on Information Theory, 198--208.
;; =====================================================================
;;
;; Additionally, the following functions are now available for storing
;; bibtex entries within Org documents.
;;
;; - Run `org-bibtex' to export the current file to a .bib.
;;
;; - Run `org-bibtex-check' or `org-bibtex-check-all' to check and
;;   fill in missing field of either the current, or all headlines
;;
;; - Run `org-bibtex-create' to add a bibtex entry
;;
;; - Use `org-bibtex-read' to read a bibtex entry after `point' or in
;;   the active region, then call `org-bibtex-write' in a .org file to
;;   insert a heading for the read bibtex entry
;;
;; - All Bibtex information is taken from the document compiled by
;;   Andrew Roberts from the Bibtex manual, available at
;;   http://www.andy-roberts.net/res/writing/latex/bibentries.pdf
;;
;;; History:
;;
;; The link creation part has been part of Org for a long time.
;;
;; Creating better capture template information was inspired by a request
;; of Austin Frank: http://article.gmane.org/gmane.emacs.orgmode/4112
;; and then implemented by Bastien Guerry.
;;
;; Eric Schulte eventually added the functions for translating between
;; Org headlines and Bibtex entries, and for fleshing out the Bibtex
;; fields of existing Org headlines.
;;
;; Org mode loads this module by default - if this is not what you want,
;; configure the variable `org-modules'.
 
;;; Code:
 
(require 'org)
(require 'bibtex)
(require 'cl-lib)
(require 'org-compat)
 
(defvar org-agenda-overriding-header)
(defvar org-agenda-search-view-always-boolean)
(defvar org-bibtex-description nil) ; dynamically scoped from org.el
(defvar org-id-locations)
 
(declare-function bibtex-beginning-of-entry "bibtex" ())
(declare-function bibtex-generate-autokey "bibtex" ())
(declare-function bibtex-parse-entry "bibtex" (&optional content))
(declare-function bibtex-url "bibtex" (&optional pos no-browse))
 
 
;;; Bibtex data
(defvar org-bibtex-types
  '((:article
     (:description . "An article from a journal or magazine")
     (:required :author :title :journal :year)
     (:optional :volume :number :pages :month :note))
    (:book
     (:description . "A book with an explicit publisher")
     (:required (:editor :author) :title :publisher :year)
     (:optional (:volume :number) :series :address :edition :month :note))
    (:booklet
     (:description . "A work that is printed and bound, but without a named publisher or sponsoring institution.")
     (:required :title)
     (:optional :author :howpublished :address :month :year :note))
    (:conference
     (:description . "")
     (:required :author :title :booktitle :year)
     (:optional :editor :pages :organization :publisher :address :month :note))
    (:inbook
     (:description . "A part of a book, which may be a chapter (or section or whatever) and/or a range of pages.")
     (:required (:author :editor) :title (:chapter :pages) :publisher :year)
     (:optional :crossref (:volume :number) :series :type :address :edition :month :note))
    (:incollection
     (:description . "A part of a book having its own title.")
     (:required :author :title :booktitle :publisher :year)
     (:optional :crossref :editor (:volume :number) :series :type :chapter :pages :address :edition :month :note))
    (:inproceedings
     (:description . "An article in a conference proceedings")
     (:required :author :title :booktitle :year)
     (:optional :crossref :editor (:volume :number) :series :pages :address :month :organization :publisher :note))
    (:manual
     (:description . "Technical documentation.")
     (:required :title)
     (:optional :author :organization :address :edition :month :year :note))
    (:mastersthesis
     (:description . "A Master’s thesis.")
     (:required :author :title :school :year)
     (:optional :type :address :month :note))
    (:misc
     (:description . "Use this type when nothing else fits.")
     (:required)
     (:optional :author :title :howpublished :month :year :note))
    (:phdthesis
     (:description . "A PhD thesis.")
     (:required :author :title :school :year)
     (:optional :type :address :month :note))
    (:proceedings
     (:description . "The proceedings of a conference.")
     (:required :title :year)
     (:optional :editor (:volume :number) :series :address :month :organization :publisher :note))
    (:techreport
     (:description . "A report published by a school or other institution.")
     (:required :author :title :institution :year)
     (:optional :type :address :month :note))
    (:unpublished
     (:description . "A document having an author and title, but not formally published.")
     (:required :author :title :note)
     (:optional :month :year)))
  "Bibtex entry types with required and optional parameters.")
 
(defvar org-bibtex-fields
  '((:address      . "Usually the address of the publisher or other type of institution.  For major publishing houses, van Leunen recommends omitting the information entirely.  For small publishers, on the other hand, you can help the reader by giving the complete address.")
    (:annote       . "An annotation.  It is not used by the standard bibliography styles, but may be used by others that produce an annotated bibliography.")
    (:author       . "The name(s) of the author(s), in the format described in the LaTeX book.  Remember, all names are separated with the and keyword, and not commas.")
    (:booktitle    . "Title of a book, part of which is being cited.  See the LaTeX book for how to type titles.  For book entries, use the title field instead.")
    (:chapter      . "A chapter (or section or whatever) number.")
    (:crossref     . "The database key of the entry being cross referenced.")
    (:edition      . "The edition of a book for example, 'Second'.  This should be an ordinal, and should have the first letter capitalized, as shown here; the standard styles convert to lower case when necessary.")
    (:editor       . "Name(s) of editor(s), typed as indicated in the LaTeX book.  If there is also an author field, then the editor field gives the editor of the book or collection in which the reference appears.")
    (:howpublished . "How something strange has been published.  The first word should be capitalized.")
    (:institution  . "The sponsoring institution of a technical report.")
    (:journal      . "A journal name.")
    (:key          . "Used for alphabetizing, cross-referencing, and creating a label when the author information is missing.  This field should not be confused with the key that appears in the \\cite command and at the beginning of the database entry.")
    (:month        . "The month in which the work was published or, for an unpublished work, in which it was written.  You should use the standard three-letter abbreviation,")
    (:note         . "Any additional information that can help the reader.  The first word should be capitalized.")
    (:number       . "Any additional information that can help the reader.  The first word should be capitalized.")
    (:organization . "The organization that sponsors a conference or that publishes a manual.")
    (:pages        . "One or more page numbers or range of numbers, such as 42-111 or 7,41,73-97 or 43+ (the â€˜+’ in this last example indicates pages following that don’t form simple range). BibTEX requires double dashes for page ranges (--).")
    (:publisher    . "The publisher’s name.")
    (:school       . "The name of the school where a thesis was written.")
    (:series       . "The name of a series or set of books.  When citing an entire book, the title field gives its title and an optional series field gives the name of a series or multi-volume set in which the book is published.")
    (:title        . "The work’s title, typed as explained in the LaTeX book.")
    (:type         . "The type of a technical report for example, 'Research Note'.")
    (:volume       . "The volume of a journal or multi-volume book.")
    (:year         . "The year of publication or, for an unpublished work, the year it was written.  Generally it should consist of four numerals, such as 1984, although the standard styles can handle any year whose last four nonpunctuation characters are numerals, such as '(about 1984)'"))
  "Bibtex fields with descriptions.")
 
(defvar org-bibtex-entries nil
  "List to hold parsed bibtex entries.")
 
(defcustom org-bibtex-autogen-keys nil
  "Set to a truth value to use `bibtex-generate-autokey' to generate keys."
  :group 'org-bibtex
  :version "24.1"
  :type  'boolean)
 
(defcustom org-bibtex-prefix nil
  "Optional prefix for all bibtex property names.
For example setting to `BIB_' would allow interoperability with fireforg."
  :group 'org-bibtex
  :version "24.1"
  :type  '(choice
       (const nil)
       (string)))
 
(defcustom org-bibtex-treat-headline-as-title t
  "Treat headline text as title if title property is absent.
If an entry is missing a title property, use the headline text as
the property.  If this value is t, `org-bibtex-check' will ignore
a missing title field."
  :group 'org-bibtex
  :version "24.1"
  :type 'boolean)
 
(defcustom org-bibtex-headline-format-function
  (lambda (entry) (cdr (assq :title entry)))
  "Function returning the headline text for `org-bibtex-write'.
It should take a single argument, the bibtex entry (an alist as
returned by `org-bibtex-read').  The default value simply returns
the entry title."
  :group 'org-bibtex
  :version "26.1"
  :package-version '(Org . "9.1")
  :type 'function)
 
(defcustom org-bibtex-export-arbitrary-fields nil
  "When converting to bibtex allow fields not defined in `org-bibtex-fields'.
This only has effect if `org-bibtex-prefix' is defined, so as to
ensure that other org-properties, such as CATEGORY or LOGGING are
not placed in the exported bibtex entry."
  :group 'org-bibtex
  :version "24.1"
  :type 'boolean)
 
(defcustom org-bibtex-key-property "CUSTOM_ID"
  "Property that holds the bibtex key.
By default, this is CUSTOM_ID, which enables easy linking to
bibtex headlines from within an org file.  This can be set to ID
to enable global links, but only with great caution, as global
IDs must be unique."
  :group 'org-bibtex
  :version "24.1"
  :type 'string)
 
(defcustom org-bibtex-tags nil
  "List of tag(s) that should be added to new bib entries."
  :group 'org-bibtex
  :version "24.1"
  :type '(repeat  :tag "Tag" (string)))
 
(defcustom org-bibtex-tags-are-keywords nil
  "Convert the value of the keywords field to tags and vice versa.
 
When non-nil, comma-separated entries in a bibtex entry's keywords
field will be converted to Org tags.  Note: spaces will be escaped
with underscores, and characters that are not permitted in Org
tags will be removed.
 
When non-nil, local tags in an Org entry will be exported as
a comma-separated string of keywords when exported to bibtex.
If `org-bibtex-inherit-tags' is non-nil, inherited tags will also
be exported as keywords.  Tags defined in `org-bibtex-tags' or
`org-bibtex-no-export-tags' will not be exported."
  :group 'org-bibtex
  :version "24.1"
  :type 'boolean)
 
(defcustom org-bibtex-no-export-tags nil
  "List of tag(s) that should not be converted to keywords.
This variable is relevant only if `org-bibtex-tags-are-keywords'
is non-nil."
  :group 'org-bibtex
  :version "24.1"
  :type '(repeat :tag "Tag" (string)))
 
(defcustom org-bibtex-inherit-tags nil
  "Controls whether inherited tags are converted to bibtex keywords.
It is relevant only if `org-bibtex-tags-are-keywords' is non-nil.
Tag inheritance itself is controlled by `org-use-tag-inheritance'
and `org-exclude-tags-from-inheritance'."
  :group 'org-bibtex
  :version "26.1"
  :package-version '(Org . "8.3")
  :type 'boolean)
 
(defcustom org-bibtex-type-property-name "btype"
  "Property in which to store bibtex entry type (e.g., article)."
  :group 'org-bibtex
  :version "24.1"
  :type 'string)
 
 
;;; Utility functions
(defun org-bibtex-get (property)
  (let ((it (let ((org-special-properties
                   (delete "FILE" (copy-sequence org-special-properties))))
              (or
               (org-entry-get (point) (upcase property))
               (org-entry-get (point) (concat org-bibtex-prefix
                                              (upcase property)))))))
    (when it (org-trim it))))
 
(defun org-bibtex-put (property value)
  (let ((prop (upcase (if (keywordp property)
                          (substring (symbol-name property) 1)
                        property))))
    (org-set-property
     (concat (unless (string= org-bibtex-key-property prop) org-bibtex-prefix)
         prop)
     value)))
 
(defun org-bibtex-headline ()
  "Return a bibtex entry of the given headline as a string."
  (letrec ((val (lambda (key lst) (cdr (assoc key lst))))
       (to (lambda (string) (intern (concat ":" string))))
       (from (lambda (key) (substring (symbol-name key) 1)))
       (flatten (lambda (&rest lsts)
              (apply #'append (mapcar
                       (lambda (e)
                     (if (listp e) (apply flatten e) (list e)))
                       lsts))))
       (id (org-bibtex-get org-bibtex-key-property))
       (type (org-bibtex-get org-bibtex-type-property-name))
       (tags (when org-bibtex-tags-are-keywords
           (delq nil
             (mapcar
              (lambda (tag)
                (unless (member tag
                        (append org-bibtex-tags
                            org-bibtex-no-export-tags))
                  tag))
              (if org-bibtex-inherit-tags
                  (org-get-tags-at)
                (org-get-local-tags-at)))))))
    (when type
      (let ((entry (format
            "@%s{%s,\n%s\n}\n" type id
            (mapconcat
             (lambda (pair)
               (format "  %s={%s}" (car pair) (cdr pair)))
             (remove nil
                 (if (and org-bibtex-export-arbitrary-fields
                      org-bibtex-prefix)
                 (mapcar
                  (lambda (kv)
                    (let ((key (car kv)) (val0 (cdr kv)))
                      (when (and
                         (string-match org-bibtex-prefix key)
                         (not (string=
                           (downcase (concat org-bibtex-prefix
                                     org-bibtex-type-property-name))
                           (downcase key))))
                    (cons (downcase (replace-regexp-in-string
                             org-bibtex-prefix "" key))
                          val0))))
                  (org-entry-properties nil 'standard))
                   (mapcar
                (lambda (field)
                  (let ((value (or (org-bibtex-get (funcall from field))
                           (and (eq :title field)
                            (nth 4 (org-heading-components))))))
                    (when value (cons (funcall from field) value))))
                (funcall flatten
                     (funcall val :required (funcall val (funcall to type) org-bibtex-types))
                     (funcall val :optional (funcall val (funcall to type) org-bibtex-types))))))
             ",\n"))))
    (with-temp-buffer
      (insert entry)
      (when tags
        (bibtex-beginning-of-entry)
        (if (re-search-forward "keywords.*=.*{\\(.*\\)}" nil t)
        (progn (goto-char (match-end 1)) (insert ", "))
          (search-forward ",\n" nil t)
          (insert "  keywords={},\n")
          (search-backward "}," nil t))
        (insert (mapconcat #'identity tags ", ")))
      (buffer-string))))))
 
(defun org-bibtex-ask (field)
  (unless (assoc field org-bibtex-fields)
    (error "Field:%s is not known" field))
  (save-window-excursion
    (let* ((name (substring (symbol-name field) 1))
       (buf-name (format "*Bibtex Help %s*" name)))
      (with-output-to-temp-buffer buf-name
    (princ (cdr (assoc field org-bibtex-fields))))
      (with-current-buffer buf-name (visual-line-mode 1))
      (org-fit-window-to-buffer (get-buffer-window buf-name))
      (let ((result (read-from-minibuffer (format "%s: " name))))
        (when (> (length result) 0) result)))))
 
(defun org-bibtex-autokey ()
  "Generate an autokey for the current headline."
  (org-bibtex-put org-bibtex-key-property
                  (if org-bibtex-autogen-keys
                      (let* ((entry (org-bibtex-headline))
                 (key
                  (with-temp-buffer
                (insert entry)
                (bibtex-generate-autokey))))
            ;; test for duplicate IDs if using global ID
            (when (and
                   (equal org-bibtex-key-property "ID")
                   (featurep 'org-id)
                   (hash-table-p org-id-locations)
                   (gethash key org-id-locations))
              (warn "Another entry has the same ID"))
            key)
                    (read-from-minibuffer "id: "))))
 
(defun org-bibtex-fleshout (type &optional optional)
  "Fleshout current heading, ensuring all required fields are present.
With optional argument OPTIONAL, also prompt for optional fields."
  (let ((val (lambda (key lst) (cdr (assoc key lst))))
    (keyword (lambda (name) (intern (concat ":" (downcase name)))))
    (name (lambda (keyword) (substring (symbol-name keyword) 1))))
    (dolist (field (append
            (if org-bibtex-treat-headline-as-title
            (remove :title (funcall val :required (funcall val type org-bibtex-types)))
              (funcall val :required (funcall val type org-bibtex-types)))
            (when optional (funcall val :optional (funcall val type org-bibtex-types)))))
      (when (consp field) ; or'd pair of fields e.g., (:editor :author)
        (let ((present (nth 0 (remove
                   nil
                   (mapcar
                (lambda (f)
                  (when (org-bibtex-get (funcall name f)) f))
                field)))))
          (setf field (or present (funcall keyword
                       (completing-read
                        "Field: " (mapcar name field)))))))
      (let ((name (funcall name field)))
        (unless (org-bibtex-get name)
          (let ((prop (org-bibtex-ask field)))
            (when prop (org-bibtex-put name prop)))))))
  (when (and type (assoc type org-bibtex-types)
             (not (org-bibtex-get org-bibtex-key-property)))
    (org-bibtex-autokey)))
 
 
;;; Bibtex link functions
(org-link-set-parameters "bibtex"
             :follow #'org-bibtex-open
             :store #'org-bibtex-store-link)
 
(defun org-bibtex-open (path)
  "Visit the bibliography entry on PATH."
  (let* ((search (when (string-match "::\\(.+\\)\\'" path)
           (match-string 1 path)))
     (path (substring path 0 (match-beginning 0))))
    (org-open-file path t nil search)))
 
(defun org-bibtex-store-link ()
  "Store a link to a BibTeX entry."
  (when (eq major-mode 'bibtex-mode)
    (let* ((search (org-create-file-search-in-bibtex))
       (link (concat "file:" (abbreviate-file-name buffer-file-name)
             "::" search))
       (entry (mapcar ; repair strings enclosed in "..." or {...}
           (lambda(c)
             (if (string-match
              "^\\(?:{\\|\"\\)\\(.*\\)\\(?:}\\|\"\\)$" (cdr c))
             (cons (car c) (match-string 1 (cdr c))) c))
           (save-excursion
             (bibtex-beginning-of-entry)
             (bibtex-parse-entry)))))
      (org-store-link-props
       :key (cdr (assoc "=key=" entry))
       :author (or (cdr (assoc "author" entry)) "[no author]")
       :editor (or (cdr (assoc "editor" entry)) "[no editor]")
       :title (or (cdr (assoc "title" entry)) "[no title]")
       :booktitle (or (cdr (assoc "booktitle" entry)) "[no booktitle]")
       :journal (or (cdr (assoc "journal" entry)) "[no journal]")
       :publisher (or (cdr (assoc "publisher" entry)) "[no publisher]")
       :pages (or (cdr (assoc "pages" entry)) "[no pages]")
       :url (or (cdr (assoc "url" entry)) "[no url]")
       :year (or (cdr (assoc "year" entry)) "[no year]")
       :month (or (cdr (assoc "month" entry)) "[no month]")
       :address (or (cdr (assoc "address" entry)) "[no address]")
       :volume (or (cdr (assoc "volume" entry)) "[no volume]")
       :number (or (cdr (assoc "number" entry)) "[no number]")
       :annote (or (cdr (assoc "annote" entry)) "[no annotation]")
       :series (or (cdr (assoc "series" entry)) "[no series]")
       :abstract (or (cdr (assoc "abstract" entry)) "[no abstract]")
       :btype (or (cdr (assoc "=type=" entry)) "[no type]")
       :type "bibtex"
       :link link
       :description org-bibtex-description))))
 
(defun org-create-file-search-in-bibtex ()
  "Create the search string and description for a BibTeX database entry."
  ;; Make a good description for this entry, using names, year and the title
  ;; Put it into the `description' variable which is dynamically scoped.
  (let ((bibtex-autokey-names 1)
    (bibtex-autokey-names-stretch 1)
    (bibtex-autokey-name-case-convert-function 'identity)
    (bibtex-autokey-name-separator " & ")
    (bibtex-autokey-additional-names " et al.")
    (bibtex-autokey-year-length 4)
    (bibtex-autokey-name-year-separator " ")
    (bibtex-autokey-titlewords 3)
    (bibtex-autokey-titleword-separator " ")
    (bibtex-autokey-titleword-case-convert-function 'identity)
    (bibtex-autokey-titleword-length 'infty)
    (bibtex-autokey-year-title-separator ": "))
    (setq org-bibtex-description (bibtex-generate-autokey)))
  ;; Now parse the entry, get the key and return it.
  (save-excursion
    (bibtex-beginning-of-entry)
    (cdr (assoc "=key=" (bibtex-parse-entry)))))
 
(defun org-execute-file-search-in-bibtex (s)
  "Find the link search string S as a key for a database entry."
  (when (eq major-mode 'bibtex-mode)
    ;; Yes, we want to do the search in this file.
    ;; We construct a regexp that searches for "@entrytype{" followed by the key
    (goto-char (point-min))
    (and (re-search-forward (concat "@[a-zA-Z]+[ \t\n]*{[ \t\n]*"
                    (regexp-quote s) "[ \t\n]*,") nil t)
     (goto-char (match-beginning 0)))
    (if (and (match-beginning 0) (equal current-prefix-arg '(16)))
    ;; Use double prefix to indicate that any web link should be browsed
    (let ((b (current-buffer)) (p (point)))
      ;; Restore the window configuration because we just use the web link
      (set-window-configuration org-window-config-before-follow-link)
      (with-current-buffer b
        (goto-char p)
        (bibtex-url)))
      (recenter 0))  ; Move entry start to beginning of window
    ;; return t to indicate that the search is done.
    t))
 
;; Finally add the link search function to the right hook.
(add-hook 'org-execute-file-search-functions 'org-execute-file-search-in-bibtex)
 
 
;;; Bibtex <-> Org headline translation functions
(defun org-bibtex (filename)
  "Export each headline in the current file to a bibtex entry.
Headlines are exported using `org-bibtex-headline'."
  (interactive
   (list (read-file-name
      "Bibtex file: " nil nil nil
      (let ((file (buffer-file-name (buffer-base-buffer))))
        (and file
         (file-name-nondirectory
          (concat (file-name-sans-extension file) ".bib")))))))
  (let ((error-point
         (catch 'bib
           (let ((bibtex-entries
                  (remove nil (org-map-entries
                               (lambda ()
                                 (condition-case nil
                                     (org-bibtex-headline)
                                   (error (throw 'bib (point)))))))))
             (with-temp-file filename
               (insert (mapconcat #'identity bibtex-entries "\n")))
             (message "Successfully exported %d BibTeX entries to %s"
                      (length bibtex-entries) filename) nil))))
    (when error-point
      (goto-char error-point)
      (message "Bibtex error at %S" (nth 4 (org-heading-components))))))
 
(defun org-bibtex-check (&optional optional)
  "Check the current headline for required fields.
With prefix argument OPTIONAL also prompt for optional fields."
  (interactive "P")
  (save-restriction
    (org-narrow-to-subtree)
    (let ((type (let ((name (org-bibtex-get org-bibtex-type-property-name)))
                  (when name (intern (concat ":" name))))))
      (when type (org-bibtex-fleshout type optional)))))
 
(defun org-bibtex-check-all (&optional optional)
  "Check all headlines in the current file.
With prefix argument OPTIONAL also prompt for optional fields."
  (interactive) (org-map-entries (lambda () (org-bibtex-check optional))))
 
(defun org-bibtex-create (&optional arg nonew)
  "Create a new entry at the given level.
With a prefix arg, query for optional fields as well.
If nonew is t, add data to the headline of the entry at point."
  (interactive "P")
  (let* ((type (completing-read
        "Type: " (mapcar (lambda (type)
                   (substring (symbol-name (car type)) 1))
                 org-bibtex-types)
        nil nil (when nonew
              (org-bibtex-get org-bibtex-type-property-name))))
     (type (if (keywordp type) type (intern (concat ":" type))))
     (org-bibtex-treat-headline-as-title (if nonew nil t)))
    (unless (assoc type org-bibtex-types)
      (error "Type:%s is not known" type))
    (if nonew
    (org-back-to-heading)
      (org-insert-heading)
      (let ((title (org-bibtex-ask :title)))
    (insert title)
    (org-bibtex-put "TITLE" title)))
    (org-bibtex-put org-bibtex-type-property-name
            (substring (symbol-name type) 1))
    (org-bibtex-fleshout type arg)
    (dolist (tag org-bibtex-tags) (org-toggle-tag tag 'on))))
 
(defun org-bibtex-create-in-current-entry (&optional arg)
  "Add bibliographical data to the current entry.
With a prefix arg, query for optional fields."
  (interactive "P")
  (org-bibtex-create arg t))
 
(defun org-bibtex-read ()
  "Read a bibtex entry and save to `org-bibtex-entries'.
This uses `bibtex-parse-entry'."
  (interactive)
  (let ((keyword (lambda (str) (intern (concat ":" (downcase str)))))
    (clean-space (lambda (str) (replace-regexp-in-string
                   "[[:space:]\n\r]+" " " str)))
    (strip-delim
     (lambda (str)             ; strip enclosing "..." and {...}
       (dolist (pair '((34 . 34) (123 . 125)))
         (when (and (> (length str) 1)
            (= (aref str 0) (car pair))
            (= (aref str (1- (length str))) (cdr pair)))
           (setf str (substring str 1 (1- (length str)))))) str)))
    (push (mapcar
           (lambda (pair)
             (cons (let ((field (funcall keyword (car pair))))
                     (pcase field
                       (:=type= :type)
                       (:=key= :key)
                       (_ field)))
                   (funcall clean-space (funcall strip-delim (cdr pair)))))
           (save-excursion (bibtex-beginning-of-entry) (bibtex-parse-entry)))
          org-bibtex-entries)))
 
(defun org-bibtex-read-buffer (buffer)
  "Read all bibtex entries in BUFFER and save to `org-bibtex-entries'.
Return the number of saved entries."
  (interactive "bBuffer: ")
  (let ((start-length (length org-bibtex-entries)))
    (with-current-buffer buffer
      (save-excursion
    (goto-char (point-max))
    (while (not (= (point) (point-min)))
      (backward-char 1)
      (org-bibtex-read)
      (bibtex-beginning-of-entry))))
    (let ((added (- (length org-bibtex-entries) start-length)))
      (message "Parsed %d entries" added)
      added)))
 
(defun org-bibtex-read-file (file)
  "Read FILE with `org-bibtex-read-buffer'."
  (interactive "fFile: ")
  (org-bibtex-read-buffer (find-file-noselect file 'nowarn 'rawfile)))
 
(defun org-bibtex-write ()
  "Insert a heading built from the first element of `org-bibtex-entries'."
  (interactive)
  (when (= (length org-bibtex-entries) 0)
    (error "No entries in `org-bibtex-entries'"))
  (let* ((entry (pop org-bibtex-entries))
     (org-special-properties nil) ; avoids errors with `org-entry-put'
     (val (lambda (field) (cdr (assoc field entry))))
     (togtag (lambda (tag) (org-toggle-tag tag 'on))))
    (org-insert-heading)
    (insert (funcall org-bibtex-headline-format-function entry))
    (org-bibtex-put "TITLE" (funcall val :title))
    (org-bibtex-put org-bibtex-type-property-name
            (downcase (funcall val :type)))
    (dolist (pair entry)
      (pcase (car pair)
    (:title    nil)
    (:type     nil)
    (:key      (org-bibtex-put org-bibtex-key-property (cdr pair)))
    (:keywords (if org-bibtex-tags-are-keywords
               (dolist (kw (split-string (cdr pair) ", *"))
             (funcall
              togtag
              (replace-regexp-in-string
               "[^[:alnum:]_@#%]" ""
               (replace-regexp-in-string "[ \t]+" "_" kw))))
             (org-bibtex-put (car pair) (cdr pair))))
    (_ (org-bibtex-put (car pair) (cdr pair)))))
    (mapc togtag org-bibtex-tags)))
 
(defun org-bibtex-yank ()
  "If kill ring holds a bibtex entry yank it as an Org headline."
  (interactive)
  (let (entry)
    (with-temp-buffer (yank 1) (setf entry (org-bibtex-read)))
    (if entry
    (org-bibtex-write)
      (error "Yanked text does not appear to contain a BibTeX entry"))))
 
(defun org-bibtex-import-from-file (file)
  "Read bibtex entries from FILE and insert as Org headlines after point."
  (interactive "fFile: ")
  (dotimes (_ (org-bibtex-read-file file))
    (save-excursion (org-bibtex-write))
    (re-search-forward org-property-end-re)
    (open-line 1) (forward-char 1)))
 
(defun org-bibtex-export-to-kill-ring ()
  "Export current headline to kill ring as bibtex entry."
  (interactive)
  (let ((result (org-bibtex-headline)))
    (kill-new result) result))
 
(defun org-bibtex-search (string)
  "Search for bibliographical entries in agenda files.
This function relies `org-search-view' to locate results."
  (interactive "sSearch string: ")
  (let ((org-agenda-overriding-header "Bib search results:")
        (org-agenda-search-view-always-boolean t))
    (org-search-view nil
             (format "%s +{:%s%s:}"
                 string (or org-bibtex-prefix "")
                 org-bibtex-type-property-name))))
 
(provide 'org-bibtex)
 
;;; org-bibtex.el ends here