mirror of https://github.com/Chizi123/.emacs.d.git

Chizi123
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;;; ob-octave.el --- Babel Functions for Octave and Matlab -*- lexical-binding: t; -*-
 
;; Copyright (C) 2010-2018 Free Software Foundation, Inc.
 
;; Author: Dan Davison
;; Keywords: literate programming, reproducible research
;; Homepage: https://orgmode.org
 
;; This file is part of GNU Emacs.
 
;; GNU Emacs is free software: you can redistribute it and/or modify
;; it under the terms of the GNU General Public License as published by
;; the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
;; (at your option) any later version.
 
;; GNU Emacs is distributed in the hope that it will be useful,
;; but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
;; MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
;; GNU General Public License for more details.
 
;; You should have received a copy of the GNU General Public License
;; along with GNU Emacs.  If not, see <https://www.gnu.org/licenses/>.
 
;;; Commentary:
 
;;; Requirements:
 
;; octave
;; octave-mode.el and octave-inf.el come with GNU emacs
 
;;; Code:
(require 'ob)
 
(declare-function matlab-shell "ext:matlab-mode")
(declare-function matlab-shell-run-region "ext:matlab-mode")
(declare-function org-trim "org" (s &optional keep-lead))
 
(defvar org-babel-default-header-args:matlab '())
(defvar org-babel-default-header-args:octave '())
 
(defvar org-babel-matlab-shell-command "matlab -nosplash"
  "Shell command to run matlab as an external process.")
(defvar org-babel-octave-shell-command "octave -q"
  "Shell command to run octave as an external process.")
 
(defvar org-babel-matlab-with-emacs-link nil
  "If non-nil use matlab-shell-run-region for session evaluation.
  This will use EmacsLink if (matlab-with-emacs-link) evaluates
  to a non-nil value.")
 
(defvar org-babel-matlab-emacs-link-wrapper-method
  "%s
if ischar(ans), fid = fopen('%s', 'w'); fprintf(fid, '%%s\\n', ans); fclose(fid);
else, save -ascii %s ans
end
delete('%s')
")
(defvar org-babel-octave-wrapper-method
  "%s
if ischar(ans), fid = fopen('%s', 'w'); fprintf(fid, '%%s\\n', ans); fclose(fid);
else, dlmwrite('%s', ans, '\\t')
end")
 
(defvar org-babel-octave-eoe-indicator "'org_babel_eoe'")
 
(defvar org-babel-octave-eoe-output "ans = org_babel_eoe")
 
(defun org-babel-execute:matlab (body params)
  "Execute a block of matlab code with Babel."
  (org-babel-execute:octave body params 'matlab))
 
(defun org-babel-execute:octave (body params &optional matlabp)
  "Execute a block of octave code with Babel."
  (let* ((session
      (funcall (intern (format "org-babel-%s-initiate-session"
                   (if matlabp "matlab" "octave")))
           (cdr (assq :session params)) params))
         (result-type (cdr (assq :result-type params)))
     (full-body
      (org-babel-expand-body:generic
       body params (org-babel-variable-assignments:octave params)))
     (gfx-file (ignore-errors (org-babel-graphical-output-file params)))
     (result (org-babel-octave-evaluate
          session
          (if gfx-file
              (mapconcat 'identity
                 (list
                  "set (0, \"defaultfigurevisible\", \"off\");"
                  full-body
                  (format "print -dpng %s" gfx-file))
                 "\n")
            full-body)
          result-type matlabp)))
    (if gfx-file
    nil
      (org-babel-reassemble-table
       result
       (org-babel-pick-name
    (cdr (assq :colname-names params)) (cdr (assq :colnames params)))
       (org-babel-pick-name
    (cdr (assq :rowname-names params)) (cdr (assq :rownames params)))))))
 
(defun org-babel-prep-session:matlab (session params)
  "Prepare SESSION according to PARAMS."
  (org-babel-prep-session:octave session params 'matlab))
 
(defun org-babel-variable-assignments:octave (params)
  "Return list of octave statements assigning the block's variables."
  (mapcar
   (lambda (pair)
     (format "%s=%s;"
         (car pair)
         (org-babel-octave-var-to-octave (cdr pair))))
   (org-babel--get-vars params)))
 
(defalias 'org-babel-variable-assignments:matlab
  'org-babel-variable-assignments:octave)
 
(defun org-babel-octave-var-to-octave (var)
  "Convert an emacs-lisp value into an octave variable.
Converts an emacs-lisp variable into a string of octave code
specifying a variable of the same value."
  (if (listp var)
      (concat "[" (mapconcat #'org-babel-octave-var-to-octave var
                 (if (listp (car var)) "; " ",")) "]")
    (cond
     ((stringp var)
      (format "'%s'" var))
     (t
      (format "%s" var)))))
 
(defun org-babel-prep-session:octave (session params &optional matlabp)
  "Prepare SESSION according to the header arguments specified in PARAMS."
  (let* ((session (org-babel-octave-initiate-session session params matlabp))
     (var-lines (org-babel-variable-assignments:octave params)))
    (org-babel-comint-in-buffer session
      (mapc (lambda (var)
              (end-of-line 1) (insert var) (comint-send-input nil t)
              (org-babel-comint-wait-for-output session)) var-lines))
    session))
 
(defun org-babel-matlab-initiate-session (&optional session params)
  "Create a matlab inferior process buffer.
If there is not a current inferior-process-buffer in SESSION then
create.  Return the initialized session."
  (org-babel-octave-initiate-session session params 'matlab))
 
(defun org-babel-octave-initiate-session (&optional session _params matlabp)
  "Create an octave inferior process buffer.
If there is not a current inferior-process-buffer in SESSION then
create.  Return the initialized session."
  (if matlabp (require 'matlab) (or (require 'octave-inf nil 'noerror)
                    (require 'octave)))
  (unless (string= session "none")
    (let ((session (or session
               (if matlabp "*Inferior Matlab*" "*Inferior Octave*"))))
      (if (org-babel-comint-buffer-livep session) session
    (save-window-excursion
      (if matlabp (unless org-babel-matlab-with-emacs-link (matlab-shell))
        (run-octave))
      (rename-buffer (if (bufferp session) (buffer-name session)
               (if (stringp session) session (buffer-name))))
      (current-buffer))))))
 
(defun org-babel-octave-evaluate
  (session body result-type &optional matlabp)
  "Pass BODY to the octave process in SESSION.
If RESULT-TYPE equals `output' then return the outputs of the
statements in BODY, if RESULT-TYPE equals `value' then return the
value of the last statement in BODY, as elisp."
  (if session
      (org-babel-octave-evaluate-session session body result-type matlabp)
    (org-babel-octave-evaluate-external-process body result-type matlabp)))
 
(defun org-babel-octave-evaluate-external-process (body result-type matlabp)
  "Evaluate BODY in an external octave process."
  (let ((cmd (if matlabp
         org-babel-matlab-shell-command
           org-babel-octave-shell-command)))
    (pcase result-type
      (`output (org-babel-eval cmd body))
      (`value (let ((tmp-file (org-babel-temp-file "octave-")))
           (org-babel-eval
        cmd
        (format org-babel-octave-wrapper-method body
            (org-babel-process-file-name tmp-file 'noquote)
            (org-babel-process-file-name tmp-file 'noquote)))
           (org-babel-octave-import-elisp-from-file tmp-file))))))
 
(defun org-babel-octave-evaluate-session
    (session body result-type &optional matlabp)
  "Evaluate BODY in SESSION."
  (let* ((tmp-file (org-babel-temp-file (if matlabp "matlab-" "octave-")))
     (wait-file (org-babel-temp-file "matlab-emacs-link-wait-signal-"))
     (full-body
      (pcase result-type
        (`output
         (mapconcat
          #'org-babel-chomp
          (list body org-babel-octave-eoe-indicator) "\n"))
        (`value
         (if (and matlabp org-babel-matlab-with-emacs-link)
         (concat
          (format org-babel-matlab-emacs-link-wrapper-method
              body
              (org-babel-process-file-name tmp-file 'noquote)
              (org-babel-process-file-name tmp-file 'noquote) wait-file) "\n")
           (mapconcat
        #'org-babel-chomp
        (list (format org-babel-octave-wrapper-method
                  body
                  (org-babel-process-file-name tmp-file 'noquote)
                  (org-babel-process-file-name tmp-file 'noquote))
              org-babel-octave-eoe-indicator) "\n")))))
     (raw (if (and matlabp org-babel-matlab-with-emacs-link)
          (save-window-excursion
            (with-temp-buffer
              (insert full-body)
              (write-region "" 'ignored wait-file nil nil nil 'excl)
              (matlab-shell-run-region (point-min) (point-max))
              (message "Waiting for Matlab Emacs Link")
              (while (file-exists-p wait-file) (sit-for 0.01))
              "")) ;; matlab-shell-run-region doesn't seem to
        ;; make *matlab* buffer contents easily
        ;; available, so :results output currently
        ;; won't work
        (org-babel-comint-with-output
            (session
             (if matlabp
             org-babel-octave-eoe-indicator
               org-babel-octave-eoe-output)
             t full-body)
          (insert full-body) (comint-send-input nil t)))) results)
    (pcase result-type
      (`value
       (org-babel-octave-import-elisp-from-file tmp-file))
      (`output
       (setq results
         (if matlabp
         (cdr (reverse (delq "" (mapcar
                     #'org-babel-strip-quotes
                     (mapcar #'org-trim raw)))))
           (cdr (member org-babel-octave-eoe-output
                (reverse (mapcar
                      #'org-babel-strip-quotes
                      (mapcar #'org-trim raw)))))))
       (mapconcat #'identity (reverse results) "\n")))))
 
(defun org-babel-octave-import-elisp-from-file (file-name)
  "Import data from FILE-NAME.
This removes initial blank and comment lines and then calls
`org-babel-import-elisp-from-file'."
  (let ((temp-file (org-babel-temp-file "octave-matlab-")) beg end)
    (with-temp-file temp-file
      (insert-file-contents file-name)
      (re-search-forward "^[ \t]*[^# \t]" nil t)
      (if (< (setq beg (point-min))
         (setq end (point-at-bol)))
      (delete-region beg end)))
    (org-babel-import-elisp-from-file temp-file '(16))))
 
(provide 'ob-octave)
 
 
 
;;; ob-octave.el ends here